南京市中醫院輸血科于2019完成獨立建制，2024年獲批南京市醫學重點專科，形成了配發血、出凝血檢驗、輸血相關治療和獻血服務等亞專科。現有工作人員9人，其中高級職稱2人，中級職稱4人，初級職稱3人；博士1人、碩士3人，本科5人。輸血科根據《中華人民共和國獻血法》、《醫療機構臨床用血管理辦法》和《臨床輸血技術規范》等法規，建立了ISO15189質量管理體系，輸血管理系統覆蓋臨床輸血全過程，與南京市紅十字血液中心共建獻血屋，實現科學、合理、安全、有效用血。輸血科在江蘇省輸血科中最早開展富血小板血漿（PRP）療法，2023年9月開設輸血科門診。

開展的檢驗項目：ABO血型鑒定、Rh抗原分型檢測、交叉配血、不規則抗體篩查/鑒定、Coombs試驗、抗體效價測定、血栓彈力圖試驗（TEG）、凝血和血小板功能動態監測、新血栓四項、血小板閉合時間檢測、血小板抗體檢測、抗血小板藥物監測、紅細胞葉酸測定、血小板CD分子測定。

開展的治療技術：儲存式自體輸血、術前深度自體紅細胞單采、治療性紅細胞單采、治療性血小板單采、富血小板血漿（PRP）單采、富血小板血漿（PRP）療法、血漿置換。

教學科研：招收南京中醫藥大學中西醫結合碩士研究生，承擔南京中醫藥大學本科生、研究生《外科學》“輸血”部分的理論教學，每年招收輸血醫學和醫學檢驗的實習生和進修生。2022年至2024年獲批省市科研項目6項，發表學術論文24篇，參編輸血頂級著作《中華輸血學》第二版和多篇專家共識，已完成GCP臨床試驗3項。